Nekada se smatralo da je takmičenjenatjecanje sa ranim pticama dovelo do izumiranja mnogih pterosaura.{{Citation needed|date=June 2008}} Do kraja krede postojali su samo velike vrste pterosaura. Izgleda da su manje vrste izumrle kada su ptice zauzele njihove niše.<ref>{{cite journal |author=Slack KE, Jones CM, Ando T, ''et al'' |title=Early penguin fossils, plus mitochondrial genomes, calibrate avian evolution |journal=Mol. Biol. Evol. |volume=23 |issue=6 |pages=1144–55 |year=2006 |month=June |pmid=16533822 |doi=10.1093/molbev/msj124 |url=http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/reprint/23/6/1144}}</ref> Međutim, smanjenje broja pterosaura (ako ga je uopće i bilo) ne izgleda povezano sa pticama.<ref>Copyrighted excerpt from Richard Butler, Paul Barrett, Steven Nowbath & Paul Upchurch [http://reviewsandessays2.blogspot.com/2009/03/why-pterosaurs-werent-replaced-by-birds.html]; možda treba novi link</ref> Na kraju krede, veliko izumiranje svih dinosaura i mnogih drugih životinja pogodilo je i pterosaure. Alternativno, mnogi pterosauri su se možda specijalizirali za život na oceanu.{{Citation needed|date=June 2008}} Izumiranje na kraju krede je imalo veoma velik utjecaj na [[more|morske]] životinje kojima su se pterosauri hranili, te su oni izumrli. Međutim, oblici poput pripadnika [[Azhdarchidae]] i ''[[Istiodactylus]]a'' nisu se vezivali za more.
