Neposredno nakon osvajanja titule,a Ali je skrenuo pažnju na sebe i javnim prihvaćanjem [[Islam]]a, te pod utjecajem grupe ''Nacija Islama'' uzima ime Cassius X, po ugledu na drugog poznatog člana te sekte [[MalcolmMalcolma X]]-a. Sekta je bila simbol borbe crnačkog stanovništva SAD-a protiv ropstva i ugnjetavanja. Vođa sekte uskoro daje Cassiusu njegovo novo ime - Muhammad Ali.
U to vrijeme Ali ulazi i u sukobe ses vladom SAD-a, odbijajući regrutaciju za vrijeme [[Vijetnamski rat|Vijetnamskog rata]] za što je bio osuđen. Istovremeno mu i boksačke federacije brane nastupe i oduzimaju osvojenu titulu koju je do tada uspješno branio više puta. Prekid službene karijere je trajao je oko 3 godine. Danas mnogi žale zbog tog prekida u karijeri, jer je ostalo pitanje kakav bi još napredak ostvario Ali u boksačkom smislu da nije bilo tog prisilnog odmora.