Prije stupanja na položaj uzbekistanskog premijera Mirzijojev je bio prvo guverner granične pokrajine, a potom [[Samarkand]]a između 2001. i 2003. godine. U svojoj političkoj, premijerskoj aktivnosti Šavkat je postao najpoznatiji po zahlađenju državnih odnosa s [[SAD]] nakon pokušaja državnog udara 2005. godine i jačanju političko-ekonomskih aktivnosti s [[Južna Koreja|Južnom Korejom]] što je dovelo do ugovora o prodaji urana <ref name=SK>[http://www.rferl.org/featuresarticle/2006/9/557d2098-4f9f-4d77-8a30-e3f28745201b.html "South Korea, Uzbekistan Sign Uranium Deal"], RadioFreeEurope/RadioLiberty, September 25, 2006.</ref> i povećanju trgovine među državama od 40 % između 2005. i 2006. godine <ref name=SK/>. Nakon smrti dugogodišnjeg uzbekistanskog predsjednika [[Islam Karimov|Islama Karimova]] 2. rujna 2016., Mirzijojev je imenovan prijelaznim predsjednikom. Na predsjedničkim izborima 4.prosinca uvjerljivo je pobijedio sa osvojenih 88,6% glasova. Dužnost je preuzeo na inauguraciji 14.prosinca. Pobjeda Mirzijojeva je bila očekivana jer je od početka slovio kao favorit. Iako je obećao nasljedovati politiku svog prethodnika,početak njegove vladavine obilježavaju reforme društva, a posebno su vidljive promjene u vanjskoj politici.<ref>{{cite news|url=https://www.ft.com/content/92a19386-baf0-11e6-8b45-b8b81dd5d080|title=New Uzbekistan president’s conciliatory tack brings hope of change|work=[[Financial Times]]|}}</ref> Pokrenuo je proces obnove odnosa sa [[Kirgistan|Kirgistanom]] i [[Tadžikistan|Tadžikistanom]] koji su u vrijeme Karimova bili ozbiljno narušeni.<ref>{{cite web|url=http://www.eurasianet.org/node/80721|title=Uzbekistan: Mirziyoyev Flirting With Regional Reset?|author=|date=|publisher=Eurasianet.org|accessdate=29 September 2016}}</ref><ref>https://www.ft.com/content/92a19386-baf0-11e6-8b45-b8b81dd5d080</ref> Mnogo medijske pozornosti izazvao je posjet turskog predsjednika [[Recep Tayyip Erdogan|Recepa Tayyipa Erdogana]] Uzbekistanu u studenom 2016. gdje je dogovorena obnova također narušenih odnosa između dvije zemlje. Prvi je to posjet Erdogana Uzbekistanu nakon više od 13 godina.<ref>Uzbekistan Daily: President of Turkey to pay official visit to Uzbekistan </ref> Uzbekistan je po prvi put nakon 1994. posjetio i bjeloruski predsjednik [[Aleksandar Lukašenko]].<ref>http://president.gov.by/en/news_en/view/working-visit-to-uzbekistan-14580/</ref>
