Jedna od glavnih osobina korištena u podjeli ljudske vrste na tzv. rase je boja kože. Ljudi tamnije boje kože naseljeni su upravo u [[Tropski pojas|tropskom pojasu]], gdje ih koža s povećanom količinom [[Melanin|melanina]] štiti od jačeg Sunčevog [[Ultraljubičasto zračenje|ultraljubičastog zračenja]], dok su oni svijetlije boje kože naseljeni bliže polovima gdje je manja [[insolacija]], pa tako koža s manje melanina dopušta zdravoj količini zračenja dati energiju za sintezu [[Vitamin D|vitamina D]].
[[Boja očiju]], osobina usko vezana s bojom kože, također se koristila u rasističkoj ideologiji za podjelu na rase.
Boju kože stvaraju brojni [[pigment]]i među kojima je najvažniji - [[melanin]]. Taj pigment u visokoj koncentraciji određuje najtamnije boje. Melanin je ustvari pročišćivać za [[ultraljubičaste zrake]]. Iako je prevelika količina ultraljubičastih zraka štetna za [[Koža|kožu]], neka određena količina je potrebna. To je zato jer one omogućuju [[Sinteza|sintezu]] [[Vitamin D|vitamina D]] u dubokim slojevima epiderme. Nedostatak tog vitamina uzrokuje [[rahitis]] - dječje oboljenje najčešće u slabo [[Sunce|osunčanim]] dijelovima [[Europa|Europe]].
=== Boja očiju ===
''Glavni članak: [[Boja očiju]]''
[[Datoteka:A blue eye.jpg|thumb|100px|desno|Plava šarenica]]
Boja očiju je poligenska osobina i određuje se prema količini i vrsti pigmenta u [[Šarenica|šarenici]] oka. [[Ljudi]] i [[životinje]] imaju mnogo [[fenotip]]skih varijacija u [[boja]]ma očiju. Varijacije boja u [[Ljudsko oko|ljudskim očima]] pripisuju se različitoj razini [[melanin]]a kojeg proizvode [[melanocit]]i u šarenici. Svijetlo obojene oči mnogih ptičjih vrsta su u velikoj mjeri određene prema drugim pigmentima, kao što su [[pteridin]]i, [[purin]]i i [[karotenoid]]i.
Tri glavna elementa unutar šarenice doprinose boji: melanin u [[pigment]]nom [[epitel]]u šarenice, melanin unutar strome šarenice i stanična gustoća strome šarenice. U očima svih boja, pigmentni epitel šarenice sadrži crni pigment, melanin. Varijacije boja među različitim šarenicama su obično određene sadržajem melanina unutar [[stroma|strome]] šarenice. Gustoća stanica u stromi utječe na to koliko svjetlosti će apsorbirati temeljni pigmentni epitel. OCA2 genski [[polimorfizam]], blizu proksimalne 5 'regulatorne regije, objašnjava većinu varijacija u boji ljudskih očiju.
