Rodjen je u [[Rim]]u, ali godina i datum rođenja nisu poznati. Dolazio je iz ugledne rimske patricijske obitelji, njegov se otac Ivan, smatra bizantskim carskim namjesnikom jedne od dviju provincija na koju je [[Italija]] tada bila podijeljena. O Pelagiju svjedoče izvori iz [[536.]] godine kada je bio pratitelj [[Agapet I.|pape Agapeta I.]] na njegovom putu u [[Konstantinopol]]. Tu ga je papa ostavio kao [[nuncij]]a<ref>[http://www.newadvent.org/cathen/11602a.htm Pope Pelagius I - newadvent.org]</ref> rimske crkve na bizantskom dvoru [[536.]] godine. Na dvoru se Pelagije zbližio sas carem Justinijanom I., tako da je imao veliki utjecaj na njega. Predlagao mu za postavljanja i smjenjivanja Carigradskih patrijarha i dr. Kada je [[Vigilije|papa Vigilije]] otišao u Konstantinopol po nalogu cara Justinijana I., Pelagije je ostao u [[Rim]]u kao njegov [[Papinski legat|legat]]. Tada je počela ostrogotska opsada [[Rim]]a, pod vodstvom njihovog kralja Totila. Pelagije se pokušavao dodvoriti Totili, kako bi odustao od opsade i napada na [[Rim]], i tako pomoći svojim gladnim sugrađanima. Njegovi napori nisu urodili plodom, i Totila je zauzeo [[Rim]] u prosincu [[546.]] Totila je ipak poštedio građane i pristao poslati Pelagija u Konstantinopol kao pregovarača, koji je trebao u njegovo ime dogovoriti mir sa Justinijanom I. Justinijan je odbacio Totilove prijedloge, i poslao ga natrag u [[Rim]] sa porukom da je za [[Bizant]], njihov zapovjednik Velizar, pravi vladar Italije, a da sa njim nemaju što pregovarati.
