Hirudin je enzim (polipeptid), kojega medicinska pijavica (Hirudo medicinalis) izlučuje iz svojih slinskih žlijezda kako bi spriječila grušanje krvi životinje kojoj siše krv.

Struktura hirudina u kompleksu s trombinom.

Britanski fiziolog John Berry Haycraft otkrio ga je 1884., a njegova struktura razjašnjena je 1967. Danas se hirudin upotrebljava prvenstveno u zdravstvu, za sprečavanje tromboze.