Najčešća bolest u kojoj dolazi do poremećaja metabolizma glikogena je šečernašećerna bolest ([[diabetes mellitus]]) kod koje zbog povišene koncentracije inzulina, može doći do abnormlanogabnormalnog nakupljanja ili potrošnje glikogena.
KondKod hipoglikemija uzrokovanih prevelikom količinom inzulina, količina jetrenih glikogena je velika, ali visokvisoka količina inzulina nedopuštane dopušta glikogenolizu nužnu za održavanja razine glukoza u krvi, pa je potrebna primjena [[glukagon]]a.
[[Glikogenoza|Glikogenoze]] su bolesti do kojih dolazi zbog poremećaja enzima koji sudjeluju u sintezi i razgradnji glikogena.
