U toku 2001. godine postala je ruski reket broj 1, prethodno držanu poziciju od strane
[[AnneAnna Kournikova|Ane Kurnjikove]]. Iste godine doživjela je povrijedu ramena u [[Australija|Australiji]] i da bi nastavila igrati tenis, pronalazi način za alternativno servisiranje, koje su mnogi stručnjaci okarakterisali kao jedno od najlošijih u povijesti ženskog tenisa. Bez obzira na ovakvu odluku, Jelena se uz puno muke, uspjevala održati u samom vrhu tenisa, nastavila je pobjeđivati, uz katastrofalan ishod na kraju mečeva, jer je po statistikama znala napraviti i po nevjerovatnih 19 duplih servis grešaka u toku meča. U toku naredne godine dosla je do finala u rodnoj [[Moskva|Moskvi]], na turniru prve kategorije, pobijedom u četvrtfinalu nad tadašnjim brojem jedan [[Martina Hingis|Martinom Hingis]], sa ubjedljivih 6-2,6-2. Finale je izgubila od [[Jelena Dokić|Jelene Dokić]] rezultatom 6-3,6-3. Uspjela je treću godinu zaredom plasirati se na završni turnir u [[Los Angeles]]u, kao jedna od osam najboljih tenisačica u tekućoj godini.
